- Generar capacidades interinstitucionales para la evaluación y monitoreo integral del estado de conservación de las poblaciones de interés pesquero y de la fauna acompañante, con énfasis en la región del Golfo Matías.
- Desarrollar técnicas de cultivo de especies comerciales y diseñar estructuras para captación y crecimiento.
- Evaluar las interacciones y el impacto de las actividades turísticas sobre las especies y los hábitats.
- Intensificar el conocimiento sobre las áreas protegidas y sus áreas aledañas, en los aspectos sensibles de estos ecosistemas.
- Transferir conocimiento científico-tecnológico a las áreas de gobierno y al medio socioproductivo para su incorporación a los planes de manejo de los recursos y de las Áreas Marinas Protegidas.
- Expandir las áreas de conocimiento poco exploradas en la región, como: Paleontología, Genética Molecular, Antropología, Limnología.